听完钱余的问题，博士生率先开了口。不过他并没有提太多建议，反而有些抱怨。
　　“我认为，这一计划自然是要找现成的突变体，或者……由我们自己‘诱发’斑马鱼突变咯。”
　　“只可惜我们研究的斑马鱼——现有的突变体库实在太少。”
　　“我女朋友在高校研究肿瘤细胞，她从网上那些可用的数据库里筛选，基本上能够‘一抓一个准’，可令我眼红啦！”
　　博士生说着说着，忽然感觉自己是“输在了起跑线上”。
　　钱余也不禁笑着点了点头，算是同意了他的说法。
　　确实，说起大型的“库藏”资源受益者，最令钱余羡慕的，当属陈幸和郭子昱。
　　这小两口都研究癌症，而公共医疗数据库收集的资源，大多包括癌症患者的基因组数据——癌症患者通常会出现某些肿瘤相关基因的突变，当这些基因呈现表达异常的时候，人类体内便可能出现肿瘤细胞，继而形成癌症。
　　这些患者对于其他“无瘤”的健康人来说，也就称得上是“突变体”了。
　　钱余接着评价道：“不过呀，肿瘤的数据资源虽然有，但是要完成数据处理，科研人员也必须经历一番周折。”
　　于是，钱余向学生们解释了何为“一番周折”。
　　多年以前，郭子昱刚考上研究生。
　　当时他的硕士导师，手头上积累的临床数据不足，又没有多余的经费请公司做生物芯片。因此导师希望能从公共数据库中，获取可用的数据资源，从而挖掘潜在的“肺癌耐药相关因子”——于是，刚入学不久的郭子昱，接受了这项重要的任务。
　　在全球范围内，能够免费获取的医学公共数据库的确不少。
　　当年肿瘤医生用得最多的，是美国国家癌症研究所开发的“癌症基因组图谱”数据库，又称“TCGA”。
　　该数据库涵盖了33种肿瘤类型，收录并上传了多方研究者提供的癌症临床数据，包括肿瘤组织、正常组织、癌旁对照组的各项图谱——基因组、转录组、表观组、蛋白组数据，以及患者的肿瘤病理、癌症分期、生存情况等。
　　从网上获取原始数据并下载，倒也难不倒郭子昱，令他头疼的，主要是后期数据的处理问题。
　　TCGA提供的数据集，样本量非常大。每一个样本，均以字母和数字的组合来命名，以便于相互区分并归类。因此，数据使用者需要有一定的计算机编程基础，例如掌握R语言、Python、Perl或Linux操作系统等。同时，使用者必须具备扎实的统计学理论知识，才能利用上述语言编辑器，从庞大的数据中获取自己想要的“精髓”部分。
　　郭子昱虽然有统计学的底子，本科也修过《生物信息学》，但他的信息学基础相对薄弱——如今让郭子昱这只“菜鸟”直接上升到应用层面，他自然是吃不消的。
　　“我每天看着这一行接一行的R语言代码就‘头大’。”当时郭子昱向陈幸诉苦，“还不如让我值一周的大夜班呢！”
　　陈幸建议道：“问问你的师兄师姐呀，他们应该也做过类似的数据处理吧。”
　　“做倒是做过，不过啊——他们用的那些代码，基本都是从网上‘复制粘贴、生搬硬套’的，没有多少是属于‘自己的东西’。”
　　网上的相关代码“满天飞”，可谓五花八门——虽然大多也能“殊途同归”，将各类数据进行归类处理。但这些代码毕竟是“提供者”自己写的，需要“使用者”逐字逐句看懂。有时一旦更改了某个看似无关紧要的代码，便可能出现“系统报错”，或者得出“南辕北辙”的处理结果。
　　还有不少生物相关行业，开始专程开班授课，教授广大科研人员如何利用R语言，对各大数据库的数据进行分析处理。
　　当时陈幸进实验室也才半年，尽管她自己的信息学基础扎实，但她也从未接触过如此庞大的数据处理。于是，陈幸求助于实验室的各位“前辈”。
　　“TCGA提供的代码有些繁琐，而这网上的呀，终归不是自己写的，用着总是有些不放心的。”
　　“我们手头上都有现成的代码，你到电脑上拷贝一份就行——不过呢，你最好还是自己写一套，这样以后用着也安心不是？”
　　师兄师姐们都很热心，陈幸就顺势拷贝了一份代码，交给了郭子昱。
　　但郭子昱最终还是听从了“前辈们”的建议——他咬了咬牙，充值了某个生物培训机构的“VIP终身会员”，下决心从头学起，一步一个脚印。
　　陈幸也陪着他，两人一路扶持——从基础R语言学习，到一字一句自写代码，接着利用代码处理数据，直至从数据库中，发现潜在的癌症相关因子——最终，郭子昱总算是“过五关、斩六将”，解决了自己科研生涯的“第一道难题”……
　　“研究肿瘤等疾病的科研人员，确实很有优势，他们可以从现有的资源库中获取课题——不过这现成的‘果实’啊，也不是这么容易到手的。”
　　可惜，钱余的一番言论没起到什么作用，博士生依旧一脸难过，钱余真不忍心再继续打击他。
　　“除了TCGA，还有源自欧洲的Oncomine癌症基因芯片数据库，国际癌症基因组数据库ICGC等等。”
　　“再结合NCBI开发的高通量基因表达数据库GEO，以及基于上述数据库开发的各类网站、软件——譬如，cBioPortal癌症基因组数据探索，UCSCXena基因组浏览器，miRCancer癌症小RNA数据库，TIMER肿瘤免疫浸润数据库，Kaplan-Meier生存曲线绘图仪，GEPIA数据库可视化网站……可谓数不胜数。”
　　“这些‘工具’能够给使用者提供帮助，便于他们将各大数据库的数据进行分类、汇总，大大节省了分析时间。因此，光是某一癌症的单一基因数据，就足以让科研人员眼花缭乱啦。”
　　博士生听了钱余的详细介绍，越发觉得自己不走运了。
　　“当然了，若是课题组有条件，也可以不依赖这些资源。”
　　“例如，直接将体外培养的肿瘤细胞，进行药物等特殊处理，交予生物公司做测序分析，再与对照组做对比，寻找感兴趣的癌症相关因子。”
　　钱余补充道：“不过啊，哪怕不额外花钱，肿瘤研究者从上述的数据库中，将同类型的数据自行做几个交集，也能筛选到一星半点的候选基因，有那么一些眉目。”
　　学生们不禁有些意外：“钱老师，你怎么……如此了解肿瘤方面的研究体系呀？”
　　“我也有同学和朋友是做这个的呀。”钱余摇了摇头，他并不认为这有什么值得惊讶之处。
　　“除了研究肿瘤的同行，其次能让我羡慕的，就是我之前的一位室友了——他是研究拟南芥的。”
　　钱余口中的这位室友，自然是帅小伙了。
　　当年，小帅整日在温室的花丛中“拈花惹草”，实验操作愈发熟练。晚上回到宿舍，他也常跟钱余唠嗑，聊一聊拟南芥和自己所做的工作。
　　“我听我的室友做过介绍。”
　　“千禧年伊始，人们就完成了野生型拟南芥Columbia-0的全基因组测序，名为‘拟南芥基因组计划’。于是，SALK研究所着手对其基因组的各个基因，进行了T-DNA插入和鉴定，构建了一个较为完整的突变体库，并且将突变体种子进行共享，让研究者们能够在‘拟南芥信息资源网站TAIR’上进行购买。”
　　研究人员可以根据染色体号、基因名等，在网站上寻找自己需要突变体，接着加入购物车、下单。之后，突变体种子就能从大洋彼岸运过来，经过海关检疫，最后来到自己的实验室。
　　“想要买哪个基因的突变体啊，只要课题组舍得付钱就行。”小帅曾经和钱余念叨，“其实在欧洲也有一个突变体库，名为‘欧洲拟南芥储存中心uNASC’。只不过我们实验室在那儿买得比较少，多数都在TAIR购买。”
　　但是小帅也有自己的烦恼。
　　“事实上，拟南芥研究了这么多年，那些常见的基因，基本都被研究‘透’了。虽然还有一些功能未知的基因，但我们也不能凭空去瞎猜它们的作用。如果贸然把这些突变体的种子都买回来，那不是浪费钱嘛——万一这些基因没有功能呢？”
　　“所以啊，我们就自行将野生型的拟南芥种子，开展‘EMS化学诱变’，然后筛选突变体，再接着进行基因鉴定。”
　　EMS，全称为“甲基磺酸乙酯”，是一种常用的化学诱变剂，能够诱发DNA分子产生较多的碱基突变。所以EMS属于致癌物，使用者必须做好安全防护。
　　不过小帅总有些大大咧咧，拿他的话来说，也不外乎是“把种子用EMS泡一泡”——如此简单。
　　“但是后面这筛选、鉴定的工序也挺繁琐的，还好拟南芥生长周期比较短。若是让我做其它的农作物啊，估计我要打退堂鼓咯……”
　　说到这儿，钱余朝几位学生摇了摇头：“实际上，无论针对哪一物种的研究，都会有各自的优势和不足之处——我们也无需妄自菲薄。”
　　那么，“斑马鱼的突变体库”又是怎样的情况呢？
　　钱余继续开了口：“虽然早有欧洲、美国、澳大利亚的研究机构，设立了斑马鱼突变体资源库，但若想从这些机构手中获得特定的斑马鱼突变体，并不是一件容易的事情，需要使用者解决运输、专利等等问题。”
　　对于我国大多研究者而言，这鱼的“长途跋涉”，自然比不上“干巴巴”的拟南芥种子运输，需要多花一番心思——斑马鱼资源通常以“冻存的精子”、“可复苏的胚胎”或者“成鱼”的形式进行发货，一般20尾左右起订。
　　况且，除了远洋运输、海关检疫，我们还需面临知识产权、价格高等难题。
　　“现如今，我们从‘国家斑马鱼资源中心CZRC’处，也能买到不少斑马鱼品系的胚胎或者成鱼，还有一些‘转基因鱼’的鱼苗——但这些都还远远不够。”
　　“于是从2013年开始，国内的24家科研机构联手合作，开展‘斑马鱼1号染色体全基因敲除’计划，称为‘ZAKOC联盟’（ZebrafishAllGenesKOConcortiumforChromosome1）——历时6年多，终于完成了我国首个大规模斑马鱼定向突变体库。”
　　该项目运用“CRISPR/Cas9”技术，针对斑马鱼1号染色体上的1333个基因进行敲除，成功编辑了其中的1029个基因，并且获得636个基因的1039个可传代突变体。在这些突变体中，约有1/4与人类的疾病相关。
　　2019年，我国将这一项目的学术成果进行了发表，同时对学术界公开了所有突变品系和遗传信息。这些突变体统称为“ZKO品系”，可供研究者进行订购，同时收取使用者一定的费用。
　　关于斑马鱼突变体库的背景知识，钱余也大多由顺际宁处获知。
　　当年众人谈及这一项目，顺际宁曾兴致勃勃。
　　“斑马鱼有1～25号染色体，‘ZAKOC联盟’的这项工作，也只是一个开端而已。不过这一里程碑式的项目，给了广大科研人员很大的启发——这是利用‘CRISPR/Cas9’技术开展的‘基因精准敲除’，相当有前景。”
　　“自2012年，‘CRISPR/Cas9’系统的功能机制被完整诠释，到如今也不过短短4年时间，此技术已风靡全球。”