自封为唐王、大丞相后，李渊将皇宫中的武德殿改为大丞相府，设置丞相府官署，以裴寂为长史，刘文静为司马，对各有功之臣加官进爵，然后立李建成为世子，李世民为秦公、李元吉为齐公。
　　世子就是以后的太子。据史书记载，在立谁为世子的问题上，李渊颇为踌躇。
　　李建成是长子，按照千百年来形成的嫡长子继承制原则，他是当仁不让的世子。但李世民是晋阳起兵首谋，李渊今天能官拜相、爵封王，一大半的功劳应归于李世民。谁打的江山应由谁来坐，按这个规矩，李世民应当为世子。
　　李渊犯难了，他不希望世子之争影响两兄弟的感情，更不愿意看到刚起步的大业由此折戟沉沙，毁于一旦。不过，李渊内心的天平还是倾向长子李建成，建成成熟、稳重，在外出为官、征战的日子，李渊总是将家托咐给建成。对一国之君来说，国与家其实是无法分开的，国就是家。
　　李渊试探着问二郎李世民：“晋阳起兵，皆你之功，以你为世子如何？”没想到李世民一口回绝。
　　李世民明白，现在还远不是与大哥争夺储君之位的时候，眼下他也没有足够的本钱。
　　李渊松了一口气，在封李世民为秦公同时，以其为京兆尹，掌管京城事务。
　　一、薛举的大秦帝国
　　虽然占据了长安，但形势对李渊父子来说并不乐观。东面的隋将屈突通一心想着打进关中，收复长安，与刘文静等在潼关形成相持之势。西面的薛举也是对关中虎视眈眈。
　　薛举，兰州金城（今甘肃兰州市）人，家境富有，喜欢交结豪桀（多半是些泼皮无赖），在隋朝末年官拜金城府校尉（相当于近代的保安司令）。
　　当时各地没饭吃的贫民纷纷上山做强盗，金城也不例外。
　　有匪就得剿。金城县令郝瑗招募了数千人，由薛举率领前去剿匪。为了鼓舞士气，官军出发前，郝瑗特地举办了一场誓师大会。
　　郝瑗刚端起酒杯，想要对官兵们说两句勉励的话。突然，两把钢刀架在了他的脖子上，薛举和他的儿子薛仁果领着十几名同党站起来，围在了他身旁。
　　“薛举，你想干什么？”郝瑗还想摆出县令的架子，厉声对薛举喝道，但声音已然在颤抖。
　　“没什么，我们抓反贼啊。”
　　“谁是反贼？”郝瑗问。
　　“你啊，如果你不是想造反，私下招募这么多兵干什么？”
　　郝瑗一时气塞。没有征得朝廷允许，私下募兵，那可是死罪。可金城周围全是土匪，兵力不足，如何围剿？要去禀报朝廷，可皇帝在江都，山遥路远，要等到猴年马月？
　　薛举本来就是金城一霸，在当地势力极为强大。郝瑗一个外乡人，如何压得住这条地头蛇？
　　薛举下令开仓放粮，赈济灾民，首要的赈济对象就是刚刚招募的数千名士兵。这些士兵本来就是因为穷而提着脑袋来混饭吃，现在可以领粮食了，当然满心欢喜，听从薛举号令，帮着囚禁隋朝官员。
　　郝瑗没辙了，乖乖地成了薛举的下属，两人的上下级关系瞬间倒过来了。
　　就这样，薛举轻而易举地控制了金城府，自称西秦霸王，改年号为秦兴，封儿子薛仁果为齐王，小儿子薛仁越为晋王。附近的强盗头子宗罗睺带领部下归顺薛举，薛举封宗睺为义兴王。
　　造反后，薛举紧接着攻取了枹罕（今甘肃临夏）、西平（今青海乐都县）、浇河（今青海贵德）等郡，占领了陇西全部土地，兵力十三万。
　　大业十三年（617年）七月，薛举自称秦帝，立妻子鞠氏为皇后，儿子薛仁果为太子，然后攻取天水（今甘肃天水市），并将都城迁往天水。
　　二、河西大凉王李轨
　　薛举造反，打破了河西走廊表面上的宁静。
　　武威郡（今甘肃武威）鹰扬府司马李轨警觉起来，他料定薛举必然向西扩张，侵犯武威。按理说，碰到这种情况，李轨应当向领导汇报，或与同僚商议。可他没这么做，他召集了曹珍、关谨、梁硕、李赟、安修仁等一帮豪桀开会，商量对策。
　　商量的结果是，大家一致认为政府官员平庸胆小，无法抵御薛举，与其坐而待毙，不如造反称王。
　　确定对策后，会议进入第二个议题，谁当老大？
　　可能大家会认为，老大谁不想当啊？不想当将军的士兵不是好士兵！
　　恰恰相反，这几个人谁也不愿意当这个老大。
　　记得秦朝末年，沛县的民众杀了父母官造反，要挑一个领头的来主事。当时呼声较高的人选主要有萧何、曹参、夏侯婴、刘邦等人。论资历、论官职、论声望，刘邦都没法跟萧何、曹参等人相比，但最后领头的却是刘邦。因为萧何、曹参等人都不想挑这个头。
　　如果你挑头，当了老大，你必须在这条道上走到黑，没有回旋的余地。如果你只是位副手，那还好，当你主子撑不下去的时候，还可以换一个主子。如果心狠一点的话，来个卖主求荣，还可以发笔不小的财。
　　现在的李轨、曹珍等人也碰到同样的困境，没人愿意领头。最后曹珍说：“民间传闻李氏当王，我们这里面只有一个人姓李，这不是天命吗？”
　　大家的目光齐刷刷地看向了李轨。最后大家一致决定，老大非你李轨莫属了。
　　公元617年（大业十三年，义宁元年）七月，李轨等人联合当地胡人，共同起兵，正式扯起了造反大旗。李轨自称河西大凉王。
　　不出李轨所料，薛举站稳脚跟后，果然派兵西渡黄河，侵犯武威郡。李轨立即派将军李赟率兵迎敌，两军在昌松（今甘肃古浪县）会战。结果薛举的军队大败，全军覆没。随后，李轨攻下张掖、敦煌、西平、枹罕等郡，占领了河西走廊。
　　三、薛举东进
　　薛举向西拓展失利，转而掉头东进，进兵关中，却被李渊抢先了一步。长安已经被李渊占领。
　　如果当时李渊听从裴寂的意见，大军留在河东与屈突通对抗，哪怕只是停留十天半月，历史都可能会是另一番模样。
　　关中四塞之国，沃野千里，对薛举的诱惑实在太大了。更重要的是，李渊刚占据长安，根基不稳，薛举想乘他立足未稳之际，一举将他歼灭。
　　义宁元年（617年，即大业十三年）十二月，薛举派太子薛仁果领兵进攻扶风（今陕西凤翔），谋取长安。
　　当时扶风郡太守为李渊老婆的堂弟窦琎，扶风郡西边的汧源（今陕西陇县）则由造反头子唐弼占领。
　　唐弼造反比李渊早得多。大业十年（614年）二月，唐弼在扶风起兵，部队很快发展到十余万人。唐弼自己没有当老大，而是立李弘芝为天子，自称唐王。
　　李渊因为忙，暂时还没顾得上唐弼这支部队。唐弼呢，也没有答理李渊，说不定他心里还有点气：你李渊称什么王不好，为什么偏偏和我一样，要称“唐王”？
　　薛仁果进攻扶风，在汧源遭到唐弼的抵抗。薛举派人招降唐弼。
　　唐弼造反并不是为了争夺天下，只是迫不得已，混口饭吃。如果因此能够像宋江等人一样被招安，弄个官当当，那当然更好。
　　唐弼很快就同意向薛举投降。他杀掉天子李弘芝，派使者去天水和薛举商量投降的具体事宜。然后唐弼就坐在汧源的大帐里等啊等，一边等使者回来，一边做着当官的美梦。让他万万没想到的是，他没有等来使者，却等来了薛仁果的大军。
　　薛仁果力气大，作战勇猛，骑马射箭无不精通，军中号称万人敌，但性情贪婪，残忍好杀，曾经将俘虏活活架在火上，当烧烤一点一点割吃掉。在攻克天水后，薛仁果将全部富人头朝下挂起来，从鼻子中灌醋，命他们交出金银财宝。薛举本人也是一个残暴的主，但对儿子薛仁果的所作所为仍然感到吃惊，常常告诫他：“你的才能足以办成大事，但苛虐残忍，无情寡恩，总有一天我们这个国家会败在你手里。”
　　乘唐弼毫无防备之际，薛仁果发起了猛烈进攻。唐弼一败涂地，队伍悉数被薛仁果兼并，只带着数百骑兵逃往扶风，想投靠李唐。失去队伍的唐弼没有了任何价值，扶风太守窦琎直接将他杀了。
　　兼并唐弼队伍后，薛举势力大振，兵力多达三十余万。
　　薛仁果将扶风紧紧包围。如果扶风失守，长安西边门户洞开，秦军可直抵长安城下。
　　李渊命李世民领兵抗击薛仁果。这是李世民第一次独立带兵作战。
　　薛仁果根本不是李世民的对手。扶风一战，李世民大破秦军，一直追到天水北边的垅坻。薛举没想到唐军如此厉害，大惊失色，很没骨气地问群臣：“古代有天子投降的事吗?”
　　他的臣子褚亮回答：“有。赵佗归汉，刘禅降晋，近代萧琮投靠隋朝，至今依然富贵。转祸为福，自古有之。”
　　这时，郝瑗上前一步，说：“陛下失言。褚亮的话太荒唐。以前汉高祖刘邦屡战屡败，蜀先主刘备败退，连妻子的命都保不住，但他们最终都成就大业。陛下怎么能一战失利，就作亡国打算呢？”
　　薛举也后悔刚才的问话，掩饰着说：“我跟大家开开玩笑。”重重地赏赐郝瑗，把他当成智囊。
　　关中西边的威胁暂时解除了，现在我们回过头来看东面。
　　屈突通与刘文静在潼关相持一月有余，始终无法越过潼关一步。时间越久，关中越稳固，对屈突通越不利。无奈，屈突通命部将桑显和率军乘夜突袭刘文静。
　　屈突通的这支部队是长安的京畿卫戍部队，战斗力非一般的地方武装可比。唐军仓猝应战，两军混战直至天明。隋军连续攻破了唐军的两座营寨，只剩下刘文静的中军大营还在苦苦支撑。主帅刘文静本人也被射伤，唐军岌岌可危。
　　就在唐军将士快绝望的时候，隋军突然停止了进攻。
　　原来桑显和看见将士经过一夜苦战，疲惫不堪，下令开饭，想让官兵吃饱饭后再接着打。
　　桑显和的这个错误把隋军即将到手的胜利彻底葬送了。趁着这个难得的空隙，刘文静悄悄命人潜入被攻破的两座营寨，杀死隋军哨兵，重新夺回了阵地。
　　等隋军吃饱饭后，他们陡然发现，一夜苦战的成果全部付之东流。唐军的士气也已经恢复。
　　更要命的是，这时唐军的一股巡逻骑兵，有数百人之多，巡逻到了隋军背后，从后面发起了攻击。刘文静军看到援兵来了，三座营寨高声大呼，同时出击。隋军一败涂地，士兵除战死外，其余都作了浮虏。
　　经此一战，屈突通的主力几乎全被歼灭。
　　有人劝屈突通投降，他哭着说：“我侍奉过两位皇帝，承受国家大恩。食君之禄却不赴君之难，这我做不到。”
　　听说长安失守，家属也被李渊俘虏，屈突通留桑显和镇守潼关，自己领兵去洛阳。
　　屈突通刚离开，桑显和就投降了刘文静。刘文静派兵，与桑显和、屈突通的儿子屈突寿一起追赶，在稠桑（今河南灵宝北）追上了屈突通。
　　屈突通命军队围成一圈，严阵以待。他的儿子屈突寿上前劝降，屈突通大骂：“你来干什么？以前我们是父子，今天是仇人。”命令左右亲兵射击屈突寿。
　　这时，桑显和对屈突通身边的士兵喊道：“京城已经沦陷，你们都是关中人，家属在长安，去洛阳干什么？”。
　　所有士兵全都放下武器投降。屈突通无计可施，朝东南面拜了两拜：“臣力量已经用尽，不敢辜负国恩，天地神灵可以作证。”最终选择投降。
　　至此，李渊父子牢牢控制了关中，并以此为基地，南征北战，最终一统天下。